中央空調的清洗較好在運行前的水壓試驗之后進行。中央空調清洗完成后，應當用妥善的方法把設備保護起來。此化學清洗時間過早，清洗干凈的金屬表面有可能生銹或重新被污染。清洗時間過早，以免影響正常的運行期。
定期清洗時在中央空調運行一段時間之后即進行一次清洗。對冷卻水系統和冷凍水系統，具體的時間間隔應在總結設備運行周期和結垢之間的關系的基礎上確定。對中央空調通風管系統，應在國家的有關規定和對風道污染物和細菌總數的檢測結果的基礎上確定。
根據結垢量決定清洗時機。采用這種方法時，較好是從中央空調設備中割取一端管樣，根據管內的結垢量決定清洗與否。割管的部位應挑選較易結垢的地方。管段割下以后，先稱取重量，然后用緩蝕酸清洗干凈，再次稱重量去管內表面尺寸，即可按下或求得結果：
P=（W—Wo）/A
P—結垢量，g/平方米
Wo—清洗后的管重g
W—結垢管重g
A— 管段內的表面積平方米
根據設備運行參數決定清洗時機。對裝有檢測儀器的中央空調設備，設備內是否發生結垢和結垢的程度如何，都能從運行參數上反映出來。這時，只需總結出運行參數的變化與結垢程度之間的關系就可以判斷設備是否應該清洗。對中央空調的換熱器，只要檢測進水，出水溫度，就可根據溫差見小的程度來判斷結垢的程度。當然，這些方法即可用來確定清洗時機，又可用來判斷清洗效果。
從經濟上考慮決定清洗時機。以上幾種清潔時機的確定方法主要考慮了設備安全和正常運行，在保證安和生產的基礎上，也可以從經濟上考慮，按照能量節約的費用大與化學清洗投資的原則來決定化學清洗的時機。能量節約的費用，對于中央空調換熱器來說就是節約的水電費。
中央空調清洗應該如何操作？
由于中央空調系統在長期運行的過程中，容易出現灰塵沉積與阻塞等現象，這樣造成空調風力受阻和機組能力下降，解決這些問題較根本的方法，就是對中央空調系統進行全面的清洗，中央空調如何清洗呢，本文將對中央空調清洗方法進行介紹。 中央空調通風管道的清洗步驟：
通風管道系統的清洗是清洗工作中的關鍵難點，因為通風管道一般在吊頂內，即使不在吊頂內因為風管都是密封連接的，也很難清洗，常采用機械清洗方法。現在常見的清洗方式是從機組的帆布軟連接處將檢測機器人或氣動機器人放置在通風管道內，通過管道外的機器人操控箱控制通風管道內的清洗機器人，對于含塵量較多的管道系統還得用風管集塵器徹底收集管道中的垃圾，以防止造成 二次污染。
中央空調循環水系統的清洗方法：
由于大部分中央空調冷卻水系統是開式循環系統，冷卻水與空氣長期接觸，空氣中的CO2、SO2、NO2、O2等氣體便會溶解于冷卻水中，同時呈現酸性及強氧化性(如冷卻水泵的葉輪出現氣蝕現象)，久而久之，冷卻水管、填料表面、集水盤形成一種含有嗜肺軍團菌、b-溶血性鏈球菌、藻類、O2 的等致病微生物附著物，嚴重的腐蝕水管、污染環境。因此清洗時采用若酸性清洗劑，采用5‰中性螯合性清洗劑EDTA、緩蝕劑、鍍膜水溶液清洗三遍，其清洗程序同中央空調水系統的清洗程序一樣。
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